使用者可以在偏好設定中設定其查詢偏好，系統將會記錄使用者的偏好設定，方便使用者執行其查詢工作。此個人化的設定包含預設索引庫、輸出設定、及其他設定等三個部分。
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使用者可於此頁面中指定預設查詢的索引庫，當使用者完成此項設定之後，可以在簡易查詢頁面中直接輸入關鍵字進行查詢，不需選擇索引庫。
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| 2. 輸出排序 |
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使用者可設定輸出結果的排序方式，目前提供下列六種排序方式，且各排序方式均提供遞增排序及遞減排序選項。
 相關度排序（系統預設值）
日期排序
大小排序
標題排序
檔名排序
作者排序
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| 3. 每頁顯示筆數 |
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此設定值代表查詢結果單頁顯示筆數，分別為10筆、20筆、50筆。
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| 4. 開啟新視窗顯示查詢結果 |
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啟動此選項後，當使用者點選任何一個查詢結果的標題時，系統會自動另開視窗顯示該筆資料。
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| 5. 顯示索引庫列表 |
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啟動此選項後，系統將會於查詢頁顯示所有索引庫，以供使用者點選；若不啟動此選項，系統則會將此列表隱藏，使用者必須自行點選『索引庫清單』連結，系統才會顯示所有索引庫。 |
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| 6. 顯示個別索引庫結果及輸出過濾選項 |
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啟動此選項後，系統將會於查詢結果頁顯示排序及單頁顯示筆數設定，以供使用者點選；若不啟動此選項，系統則會將此功能隱藏，使用者必須自行點選『更多選項』連結，系統才會顯示相關設定功能。 |
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| 7. 顯示熱門相似詞 |
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啟動此選項後，當使用者於查詢框輸入關鍵字的同時會出現熱門相似詞供使用者選擇。
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| 8. 顯示相關詞 |
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啟動此選項後，在查詢結果頁會動態產生對應的相關詞提示，幫助使用者舉一反三，迅速找到相關的資訊。
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